Markusas Knüfkenas užaugo Esene. Knüfkenas 1985 m. Esen-Kettwig baigė vidurinę mokyklą, o vėliau persikėlė į Miuncheną, kad pradėtų visuomeninės tarnybos. 1987 m. jis šešis mėnesius dirbo Miuncheno siuntų skyriuje, kad finansuotų šešių mėnesių kelionę į Australiją. Jis grįžo iš Australijos 1988 m. balandžio mėn. Jis gavo taksi licenciją ir dirbo nuolatiniu ARD serialo „Rote Erde“ „Bavaria Film“ s... Daugiau tatistu. 1990 m. vasarą jis pradėjo mokytis kaip aktorius Schauspiel Miuncheno vaidybos mokykloje. Po trejų metų jis baigė mokymus. 1994 m. vasario mėn. jis susižadėjo Herfordo miesto teatre. Tačiau prieš tai jis jau buvo nufilmavęs savo pirmuosius televizijos kūrinius. Pirmąjį svarbų vaidmenį Knüfkenas atliko 1993 m. lapkričio–gruodžio mėn. kaip dešiniojo radikalo skinhedas policijos skambučio 110 serijoje „Šeštadieniais, kai vyksta karas“, kurią režisavo Rolandas Suso Richteris. Po to sekė pagrindiniai vaidmenys kriminaliniuose serialuose, tokiuose kaip Tatort ir Notruf Hafenkante. 1995 m. Markusas Knüfkenas įsitvirtino su pagrindiniu Eddie Velteno vaidmeniu seriale „Aufachse“. Nuo tada jis pasirodė daugelyje televizijos filmų, serialų ir kino produkcijos. Knüfkenas įvardija Bang Boom Bang ir Doppelpack kaip savo asmeninius mėgstamiausius projektus. Kiti gerai žinomi kūriniai, kuriuose dalyvavo Knüfkenas, buvo „Keistas seksualiai subrendusių miesto gyventojų elgesys poravimosi sezono metu“ ir „Knockin' on Heaven's Door“. Markusas Knüfkenas buvo vedęs olandų aktorę Ellen ten Damme. Jis gyvena Hamburge nuo 2003 m. ir yra vedęs Andrea Lion, su kuria turi vaiką ir podukrą.